โดยการสอนในมหาวิทยาลัยหัวเฉียวนักศึกษาปี 1 จะเรียนพื้นฐานทางภาษาจีนและเรียนความรู้พื้นฐานทางวิทยาศาสตร์ ขึ้นปีที่ 3 จะเรียนกับผู้เชี่ยวชาญรับเชิญจากสถาบันการแพทย์แผนจีนแห่งนครเซี่ยงไฮ้ ทั้งนี้ นักศึกษาจะต้องฝึกงานที่โรงพยาบาลหัวเฉียวครึ่งปี และไปฝึกที่สถาบันการแพทย์เซี่ยงไฮ้อีกครึ่งปี ซึ่งทางมหาวิทยาลัยมีความร่วมมือกันอยู่